Mesmo com a determinação do Supremo Tribunal Federal de prorrogar as eleições até às 19h, em várias regiões do país, as urnas já foram fechadas e tiveram os boletins de urnas emitidos. 
Foi o caso das seções da Escola Estadual Brasílio Machado, na Vila Madalena, em São Paulo, recebeu, às 16h55, a ordem dada pelo cartório eleitoral de encerrar a votação às cinco da tarde. Na escola todas as seções foram fechadas e os mesários dispensados.
O mesmo aconteceu nas seções da escola Unieuro em Brasília. Graziela Pereira foi mesária na zona eleitora e recebeu a autorização para fechar as urnas às 17h07.
“Era 17h07, o sinal tocou e nós desmontamos as urnas. Não chegou nem um aviso de que era pra gente continuar e nós fechamos e encerramos a votação. Eu sou mesária e encerrei e entreguei a urna às 17h20 e estou com o recibo aqui. Não recebemos informação. Se chegou, se era pra chegar, não chegou a tempo”.
Em uma zona eleitoral de Laranjeiras, no Rio de janeiro, a situação se repetiu. A eleição foi encerrada às 17h10, as urnas foram fechadas e os boletins de urna foram impressos. Após esse procedimento, não é mais possível reiniciar a votação.
A decisão do STF de prorrogar as eleições foi anunciada exatamente no horário em que as urnas seriam fechadas, às 17h.
A medida foi tomada em caráter de urgência após um pedido da coligação do candidato a reeleição, Lula da Silva (do PT), que relatou problemas e redução na circulação de frotas de transporte público em vários estados.
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